一些糖、一些香料和一切美好事物，再加上強力的神祕化學元素「X」，轟然一聲，花花、毛毛和泡泡這三個飛天小女警誕生了。他們成為小鎮村的守護使者的精彩故事，即將登上大銀幕了。

在小鎮村這個不適合人居住的城市裡，力量就是一切，惡人橫行，正義公理蕩然無存，醉心研究的塔尼恩教授在實驗室裡研究要如何製造一個完美小女孩時，他的助理，頑皮的猴子「啾啾」打翻了化學元素「X」，轟然一聲巨響，三個具備超能力的飛天小女警出現了。

三個飛天小女警具備不可思議的力量─雷射眼、如超人般的大力氣、以及光速飛行的能力。雖然她們不是故意想傷害任何人，但淘氣的天性，加上超凡的能力，為她們製造出不小的事端，惹得小鎮村的每個大人小孩都討厭她們。

三個小女孩意志消沈，覺得她們的超能力邪惡又惹人厭。這時候「啾啾」出現了，由於同樣受到化學元素「X」的影響，他已經從一隻調皮但友善猴子，變成了邪惡的「魔人啾啾」。他對小女孩們說，他完全瞭解她們的痛苦，說服她們參與他製造出一部「美好小鎮」機器的計劃，以協助小女警們贏回小鎮村民的喜愛。天真的小女警們喜出望外，於是出發到世界各地去收集所需的材料。

但女孩們不知道，魔人啾啾跟本不是想創造美好小鎮，他只是想利用這部機器，去完成他破壞小鎮的邪惡心願！

小女警能及時發現魔人啾啾的真面目嗎？她們真的能幫助小鎮村成為更美好的地方嗎？